Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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