Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVV-1B6SEH8 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVV-1B6SEH8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms