Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms