Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms