Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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NOTOA8MTQ0 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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NOTOA8MTQ0 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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NOTOA8MTQ0 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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NOTOA8MTQ0 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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NOTOA8MTQ0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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NOTOA8MTQ0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NOTOA8MTQ0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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