Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms