Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
KLHL33A6NCF5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms