Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX4Q9Y2E6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms