Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERGIC3Q9Y282 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERGIC3Q9Y282 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERGIC3Q9Y282 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERGIC3Q9Y282 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERGIC3Q9Y282 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERGIC3Q9Y282 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERGIC3Q9Y282 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERGIC3Q9Y282 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERGIC3Q9Y282 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERGIC3Q9Y282 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms