Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRPF3Q9ULD4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRPF3Q9ULD4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms