Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBE1Q9UJT0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms