Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTNNA3Q9UI47 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms