Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM5BQ9UGL1 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms