Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms