Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TFIP11Q9UBB9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFIP11Q9UBB9 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms