Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRIT1Q9P2V4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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