Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC180Q9P1Z9 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms