Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MKS1Q9NXB0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms