Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PARVAQ9NVD7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms