Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms