Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms