Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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