Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARFGAP3Q9NP61 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms