Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REEP4Q9H6H4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms