Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLIRPQ9GZT3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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