Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP74Q9C0B2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP74Q9C0B2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms