Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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FOXQ1Q9C009 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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FOXQ1Q9C009 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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FOXQ1Q9C009 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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FOXQ1Q9C009 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1Q9C009 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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