Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM54Q9BYV2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms