Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms