Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAPERQ9BY12 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms