Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF7Q9BWX1 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms