Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC11Q9BVV2 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms