Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf50Q9BV19 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms