Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms