Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms