Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3R4Q99570 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3R4Q99570 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms