Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ARXQ96QS3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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