Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC7Q96M83 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms