Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCZQ96LD1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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