Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 NRXN1-233ENST00000630543 4500 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 NLRP2-214ENST00000543010 3576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 AKR1C8P-201ENST00000578467 2182 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 PRKG2-201ENST00000264399 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 SHPRH-202ENST00000367503 5237 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 STRN-201ENST00000263918 8168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 FBXO9-202ENST00000323557 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 BIVM-ERCC5-204ENST00000639132 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 ST3GAL6-228ENST00000613264 3399 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 UBTFL8-201ENST00000426903 2112 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 ATAD5-201ENST00000321990 6869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms