Protein–RNA interactions for Protein: Q96JT2

SLC45A3, Solute carrier family 45 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A3Q96JT2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC45A3Q96JT2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC45A3Q96JT2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC45A3Q96JT2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC45A3Q96JT2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC45A3Q96JT2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC45A3Q96JT2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC45A3Q96JT2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC45A3Q96JT2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC45A3Q96JT2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC45A3Q96JT2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC45A3Q96JT2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC45A3Q96JT2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC45A3Q96JT2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms