Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NXNL1Q96CM4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms