Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAVIN3Q969G5 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAVIN3Q969G5 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms