Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms