Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTRA1Q92743 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms