Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
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PTPRUQ92729 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
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PTPRUQ92729 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
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PTPRUQ92729 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
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PTPRUQ92729 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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PTPRUQ92729 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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PTPRUQ92729 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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PTPRUQ92729 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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PTPRUQ92729 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
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