Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PHF3Q92576 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PHF3Q92576 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PHF3Q92576 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PHF3Q92576 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PHF3Q92576 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PHF3Q92576 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHF3Q92576 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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