Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSRNP3Q8WYN3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms