Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAJA4Q8WW22 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms