Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BRSK1Q8TDC3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms